Project Honoluluは、MMCを置き換えようとしているのか

答えはYesですが、サーバー管理が当面の目標に見えますね。
Q: Is Honolulu a complete replacement for all traditional Microsoft Management Console (MMC) tools?
にその答えがあります。

逆に対応していない点についても、上記に言及があります。
基本的には、RSATで提供される「役割と機能」に関するものですね。記載されている情報を抜粋しておきます。

• AD関連、グループポリシー
• クラスター関連
• DNS、DHCP、リモートアクセス、RRAS
• ファイル関連（DFS、FSRM、iSCSIイニシエーター）
• プリント管理
• NLB
• パフォーマンスモニター
  タスクマネージャーのパフォーマンス相当は、現在のHonoluluでも表示できます。が、パフォーマンスモニターの粒度は対尾いうされていません。
• シールドデータファイル
• タスクスケジューラー
• ボリュームアクティベーション
• WSUS

上記ページは、ほかにもサポートOSや、コスト、Hyper-V Serverの管理に対する回答が書かれているので、ご一読をお勧めします。
FAQページとしてのリンクを下記に再掲しておきます。
Microsoft Project Honolulu Frequently Asked Questions